Proyecto de la EFSA explora la estandarización de WGS

Un proyecto de beca patrocinado por la Autoridad Europea de Seguridad Alimentaria (EFSA, por su sigla en inglés) sirvió como ejemplo para la estandarización de la capacitación y el informe de datos de secuenciación del genoma completo (WGS). Si bien WGS proporciona resultados rápidos y útiles en las investigaciones de brotes de enfermedades transmitidas por alimentos, es necesario alcanzar un cierto nivel de estandarización para la reproducibilidad e interoperabilidad de los resultados.

El informe señala que WGS es una herramienta fundamental para fortalecer la vigilancia mundial de los patógenos transmitidos por alimentos y sus características importantes, como la resistencia a los antimicrobianos (RAM) y la virulencia. El proyecto de beca involucró la exploración de AMR y la virulencia de los patógenos transmitidos por alimentos, y la relación de tales características con factores que incluyen geografía, fuente aislada y distribución temporal. Para lograr los objetivos del proyecto, el proyecto de becas participó en:

  • Capacitación en metodologías de evaluación de riesgos y software común.
  • Capacitación en varias plataformas integradas para el uso de la genómica en la vigilancia de patógenos transmitidos por los alimentos y la investigación de brotes.
  • Análisis in silico de genomas de patógenos transmitidos por alimentos.
  • Evaluación del potencial de WGS en investigaciones de brotes.
  • Colaboración en actividades de difusión y divulgación.

Los hallazgos del proyecto de beca se publicarán en revistas revisadas por pares y cubrirán temas como una revisión de la literatura sobre el uso de WGS para la seguridad alimentaria; una revisión sobre el uso de WGS para la investigación de brotes; y dos trabajos de investigación sobre la RAM de varias cepas de patógenos.

Noticia publicada con información de food-safety.com

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